La factura electrónica obligatoria: lo que cambia para autónomos en 2026
La Ley Crea y Crece establece la obligación de emitir facturas electrónicas en formato FacturaE para todas las transacciones entre empresas y autónomos en España. En 2026, las empresas con facturación superior a 8 millones de euros ya llevan más de un año obligadas. El plazo para el resto — autónomos y pymes con facturación inferior — ha sido prorrogado por el Gobierno, pero la implantación total se espera en 2026-2027.
Lo que significa en la práctica: si emites facturas a otras empresas o autónomos, necesitarás un software homologado capaz de generar facturas en el formato FacturaE y conectarse con las plataformas de intercambio electrónico. Todos los programas de esta comparativa están preparados para ello.
Además, en 2026 la Agencia Tributaria sigue avanzando en el Sistema de Información Inmediata (SII), que obliga a comunicar las facturas emitidas y recibidas en tiempo real para empresas de determinado tamaño. Los software modernos como Holded y Sage gestionan el SII automáticamente.
⚠️ Importante para 2026
Si usas Excel o Word para emitir facturas, estás en una situación de riesgo regulatorio. La factura electrónica obligatoria exige un software homologado. Aprovecha la transición para elegir una herramienta que también te ayude con IVA, IRPF y contabilidad — el coste de 10-50€/mes es mínimo comparado con el tiempo que ahorras y las multas que evitas.
Tabla comparativa de los mejores software de contabilidad en 2026
| Software | Precio/mes | Factura electrónica | Modelos AEAT | Banco | Mejor para |
|---|---|---|---|---|---|
| 🥇 Holded | ~49 € | Sí | Completo | Sí | Pymes y agencias |
| Quipu | ~19 € | Sí | Sí | Sí | Autónomos |
| Contasimple | ~9 € | Sí | Básico | Limitado | Autónomos bajo volumen |
| Sage 50 | ~35 € | Sí | Completo + SII | Sí | Pymes con gestoría |
| Anfix | ~29 € | Sí | Completo | Sí | Pymes con empleados |
🥇 Holded — El ERP todo-en-uno más completo para pymes
⭐ Mejor todo-en-uno
Holded
ERP cloud español · Facturación + Contabilidad + CRM + Inventario + RRHH
desde 49 €/mes
Prueba gratuita 14 días
Facturación
Contabilidad
CRM
Inventario
RRHH
Banca
Modelos AEAT
FacturaE
Basic~14€/mes — Solo facturación
Standard ★~49€/mes — Todo incluido
Advanced~99€/mes — Multi-empresa
Holded es la respuesta española a los grandes ERP internacionales: un software en la nube que integra en una sola plataforma la facturación, la contabilidad real (doble entrada, asientos automáticos), el CRM para gestionar clientes y oportunidades, el inventario, los proyectos y la gestión de RRHH con nóminas. Para pymes de entre 5 y 50 empleados que quieren evitar tener 5 herramientas separadas, Holded es la opción más coherente. La integración bancaria automática concilia movimientos bancarios con facturas sin intervención manual. Genera automáticamente los modelos 303, 130, 111, 190, 340 y 347 listos para presentar en la AEAT.
Puntos fuertes
- El único que integra ERP completo + contabilidad real
- Conciliación bancaria automática
- Todos los modelos AEAT generados automáticamente
- FacturaE y SII incluidos
- App móvil excelente para gestión en movimiento
- Empresa española — soporte en castellano nativo
Puntos débiles
- El más caro de la comparativa para funciones completas
- Excesivo para autónomos con facturación baja
- Curva de aprendizaje mayor que Quipu o Contasimple
📱 Quipu — El más sencillo y completo para autónomos
Quipu
Facturación y contabilidad para autónomos · Conectado con gestoría · IA para gastos
desde 19 €/mes
15 días gratis sin tarjeta
Facturación
Contabilidad
CRM
Inventario
Scan tickets
Banca
Modelos AEAT
FacturaE
Autónomo~19€/mes — Facturación básica
Profesional ★~29€/mes — Contabilidad + banco
Empresa~49€/mes — Multi-usuario
Quipu es el software favorito de los autónomos españoles que quieren algo más que un simple facturador pero menos complejo que un ERP completo. Su función estrella es el escaneo de tickets y facturas con reconocimiento automático: fotografías un ticket de gasolina o una factura de proveedor con el móvil y Quipu extrae automáticamente el NIF, el importe y el IVA. La conexión con tu gestoría facilita enormemente el trabajo compartido: tu gestor accede directamente a tus datos y prepara los modelos tributarios sin que tengas que exportar y enviar archivos. Compatible con factura electrónica FacturaE.
Puntos fuertes
- Escaneo de tickets con IA — automatiza la entrada de gastos
- Diseñado específicamente para autónomos españoles
- Colaboración con gestoría muy bien implementada
- App móvil excelente para registrar gastos en el momento
- Soporte en español con conocimiento fiscal local
Puntos débiles
- Sin CRM ni gestión de proyectos
- Precio algo alto para autónomos con pocos movimientos
- Informes financieros más limitados que Holded
💰 Contasimple — El más económico y sencillo para empezar
Contasimple
Facturación y gastos para autónomos · Plan gratuito disponible · Muy sencillo
desde 0 €/mes
Plan de pago desde ~9€/mes
Facturación
Contabilidad
CRM
Inventario
Scan tickets
Banca
Modelos AEAT
FacturaE
Gratis3 facturas/mes, 3 gastos/mes
Básico~9€/mes — 30 facturas, sin gestoría
Profesional ★~19€/mes — ilimitado + gestoría
Contasimple es la opción más accesible para autónomos que acaban de empezar o tienen un volumen de facturación muy bajo. Su plan gratuito (con limitaciones) permite probar el servicio sin compromiso. La interfaz es la más sencilla de todas las analizadas: crear una factura lleva menos de 2 minutos. Compatible con factura electrónica. Su mayor limitación es que no tiene una contabilidad real de doble entrada: registras ingresos y gastos, y el sistema calcula el IVA e IRPF, pero no genera el Plan General Contable completo que exigen algunas sociedades.
Puntos fuertes
- Plan gratuito real — ideal para probar
- La interfaz más sencilla del mercado
- Precio muy competitivo en planes de pago
- Suficiente para autónomos con facturación baja
- Soporte en español
Puntos débiles
- Sin contabilidad real de doble entrada
- Integración bancaria limitada en planes básicos
- No válido para sociedades con obligación de contabilidad completa
🏛️ Sage 50 — El estándar de las gestorías profesionales
Sage 50
Contabilidad profesional · SII automático · Integración gestoría · Plan General Contable
desde 35 €/mes
30 días de prueba gratuita
Facturación
Contabilidad
CRM
Almacén
Nóminas
Banca
SII + Modelos
FacturaE
Sage 50 Esencial~35€/mes — Contabilidad básica
Sage 50 Extra ★~55€/mes — + Nóminas y almacén
Sage 50 Total~75€/mes — Completo multi-empresa
Sage 50 es el programa de contabilidad que usan la mayoría de gestorías y despachos profesionales en España. Si trabajas con un gestor externo, hay muchas probabilidades de que él ya use Sage y la compatibilidad directa de archivos te ahorrar horas de trabajo. Es el software con la contabilidad más completa y rigurosa de esta comparativa: Plan General Contable completo, gestión de SII en tiempo real para empresas obligadas, cálculo automático de todos los modelos AEAT, nóminas integradas y gestión de almacén. La curva de aprendizaje es mayor, pero para pymes con necesidades contables serias, es el más potente.
Puntos fuertes
- Contabilidad más completa y rigurosa del mercado
- SII automático incluido
- Estándar de las gestorías — compatibilidad máxima
- Nóminas y RRHH integrados
- El más recomendado por asesores fiscales
Puntos débiles
- La interfaz más antigua y menos intuitiva
- Precio elevado para autónomos simples
- Curva de aprendizaje significativa
👷 Anfix — El mejor para pymes con empleados y nóminas
Anfix
Gestión integral pyme · Nóminas + Facturación + Contabilidad · Fabricado en España
desde 29 €/mes
15 días gratis
Facturación
Contabilidad
CRM
Nóminas
Banca
Modelos AEAT
FacturaE
Almacén
Básico~29€/mes — Facturación + contabilidad
Profesional ★~49€/mes — + Nóminas hasta 5 empleados
Empresa~79€/mes — Empleados ilimitados
Anfix destaca como la opción más equilibrada para pequeñas empresas con empleados que necesitan facturación, contabilidad y nóminas integradas sin el coste y la complejidad de Sage. La gestión de nóminas de Anfix es especialmente potente: calcula automáticamente las cotizaciones a la Seguridad Social, genera los TC1 y TC2 listos para presentar y mantiene el historial de empleados. La integración bancaria con más de 30 entidades financieras españolas automatiza la conciliación de movimientos. Es la alternativa más moderna y user-friendly a Sage para pymes de 2-20 empleados.
Puntos fuertes
- El mejor para pymes con empleados (nóminas integradas)
- Interfaz moderna y más intuitiva que Sage
- Integración bancaria con 30+ entidades españolas
- Empresa española — soporte fiscal local
- Precio razonable para lo que incluye
Puntos débiles
- Menos conocido — menor ecosistema de gestorías compatibles
- Sin CRM completo
- Informes menos detallados que Holded
¿Cuál elegir según tu situación?
🆕 Autónomo que empieza
Pocas facturas al mes, no tienes empleados, quieres algo sencillo y barato para cumplir con Hacienda.
🏆 Contasimple (gratis o ~9€/mes) — lo más sencillo para empezar.
👨💼 Autónomo consolidado
Varias facturas mensuales, gastos frecuentes, quieres automatizar y colaborar fácilmente con tu gestor.
🏆 Quipu Profesional (~29€/mes) — escaneo de tickets + gestoría integrada.
🏢 Pyme con equipo (sin empleados)
Empresa pequeña con varios usuarios, clientes, proyectos y necesidades de contabilidad real.
🏆 Holded Standard (~49€/mes) — ERP completo en una sola herramienta.
👷 Pyme con empleados
Empresa con 2-20 empleados que necesita gestionar nóminas, SS y contabilidad integrados.
🏆 Anfix Profesional (~49€/mes) o Sage 50 Extra si ya trabajas con gestoría.
🏛️ Ya trabajo con gestoría externa
Tu gestor lleva la contabilidad pero necesitas una herramienta compatible con la suya.
🏆 Pregunta a tu gestor qué usa — si usa Sage, esa será siempre la opción más compatible.
⚡ Empresa obligada al SII
Facturación superior a 6 millones de euros anuales, obligada al Sistema de Información Inmediata.
🏆 Sage 50 Total o Holded Advanced — ambos gestionan el SII automáticamente.
💡 Consejo final antes de decidir
Todos los software de esta comparativa ofrecen período de prueba gratuito (15-30 días). Prueba el que más te interese con datos reales antes de comprometerte. El criterio más importante que la mayoría ignora: ¿lo usarás realmente? El mejor software de contabilidad es el que efectivamente abres cada semana para registrar facturas y gastos, no el que tiene más funciones en papel.
Preguntas frecuentes sobre software de contabilidad
¿Qué programa de contabilidad es mejor para autónomos en España en 2026?
Para autónomos que empiezan: Contasimple (gratis o ~9€/mes). Para autónomos con mayor volumen y gestor: Quipu (~19-29€/mes). Para autónomos que quieren todo integrado (CRM, inventario, proyectos): Holded (~49€/mes). Para autónomos cuya gestoría ya usa Sage: Sage 50 Esencial (~35€/mes).
¿Es obligatoria la factura electrónica para autónomos en 2026?
Sí, la Ley Crea y Crece establece la obligación de factura electrónica para transacciones entre empresas y autónomos. Las empresas con más de 8 millones de facturación ya están obligadas. Para el resto, el plazo definitivo se estima entre 2026 y 2027. Todos los programas de esta comparativa ya están homologados para emitir facturas en formato FacturaE.
¿Necesito un gestor si uso un software de contabilidad?
No es obligatorio para las tareas básicas, pero la mayoría de autónomos siguen trabajando con gestor para la presentación de modelos tributarios (303, 130, 111, 190) y la declaración de la renta. Los software modernos facilitan la colaboración con tu gestor exportando datos en los formatos que necesitan. Para sociedades, la contabilidad completa suele requerir un contable o gestor.
¿Qué diferencia hay entre un programa de facturación y uno de contabilidad?
Un programa de facturación solo te permite emitir facturas y registrar gastos para calcular IVA e IRPF. Un programa de contabilidad real incluye además el Plan General Contable, asientos contables de doble entrada, balance de situación y cuenta de resultados. Para autónomos en estimación directa simplificada, la facturación puede ser suficiente. Para sociedades o autónomos en estimación directa normal, se necesita contabilidad completa.
¿Cuánto puede ahorrar un autónomo con un buen software de contabilidad?
El ahorro va por dos vías. Tiempo: un autónomo sin software dedica entre 2 y 5 horas mensuales a tareas administrativas manuales que se reducen a 30-60 minutos con un buen software. Dinero: muchos autónomos pagan más IVA del necesario por no registrar correctamente todos los gastos deducibles. Un software que facilita el registro de gastos con escaneo de tickets puede recuperar cientos de euros anuales en deducciones.